Аналіз давньої ДНК показав, що чума не зникла з Європи після «Чорної смерті» XIV століття, а багаторазово поверталася протягом понад 400 років, змінюючись генетично та поширюючись шляхами торгівлі, міграції й воєн. Про це йдеться у дослідженні міжнародної команди під керівництвом Тартуського університету, про яке розповідає ScienceDaily.

Як давня ДНК відтворює історію чуми
«Чорна смерть» найбільше відома як катастрофічна хвиля чуми 1347–1353 років, що забрала життя мільйонів європейців. Однак сама хвороба не зникла після цього першого спалаху. Вона знову і знову поверталася упродовж більш ніж чотирьох століть, періоду, який історики називають Другою пандемією чуми.
Щоб зрозуміти, що відбувалося в ці століття, вчені проаналізували ДНК бактерії Yersinia pestis, збудника чуми, з людських решток, знайдених на 11 археологічних пам’ятках в Естонії, Росії, Англії, Нідерландах і Швейцарії. Команда реконструювала 26 давніх геномів зразків, датованих від XIV до XVIII століть, тобто основної частини Другої пандемії.
Генетичні дані свідчать, що чума не просто вціліла в одному «резервуарі» та неодноразово розходилася з єдиного джерела. Натомість хвороба, ймовірно, неодноразово з’являлася наново в різних регіонах Європи, створюючи кілька довготривалих осередків, де бактерія могла зберігатися.
Естонія виявилася одним із регіонів, що зазнавав ударів чуми неодноразово. Генетичні сліди свідчать про кілька окремих занесень збудника в цей регіон протягом майже всієї Другої пандемії, що пов’язують з активними зв’язками Естонії з іншими частинами Європи.
Розгалуження ліній чуми та роль клімату
Один з найяскравіших епізодів, зафіксованих у генетичних даних, припадає на період близько 1450–1500 років. Тоді лінії Yersinia pestis зазнали значного розширення і розділилися щонайменше на три важливі гілки. Дослідники припускають, що саме вони могли допомогти сформувати нові природні резервуари бактерії серед диких гризунів.
На це розширення могли впливати й кліматичні фактори. Автори згадують Велику ренесансну посуху як один із можливих чинників. Сучасні спостереження за осередками чуми показують, що зміни клімату істотно впливають на спалахи серед диких гризунів — природних хазяїв збудника.
За словами провідної авторки, професорки Крістіни Тамбец (Kristiina Tambets), команда виявила ознаки повторних занесень чуми до Естонії вже з кінця XIV століття і описала кілька раніше невідомих генетичних ліній як у міських, так і в сільських похованнях.
Як точніше датували давні спалахи чуми
Одна з головних проблем вивчення давніх пандемій — встановити точний час давніх інфекцій. Під час пандемії COVID‑19 вчені могли відстежувати варіанти вірусу з високою точністю, адже послідовності геномів мали чіткі дати відбору зразків. У випадку давніх захворювань подібних «міток часу» зазвичай немає.
Археологічні рештки найчастіше датують радіовуглецевим методом, який дає широку часову «вилку» — від десятків до понад ста років. Як пояснює головний автор дослідження, доктор Марсель Келлер (Marcel Keller), це суттєво обмежує можливість пов’язати конкретні геноми з окремими епізодами епідемій.
Щоб звузити ці інтервали, команда розробила новий підхід. Вони визначали місце кожного давнього генома на еволюційному дереві Y. pestis і, з огляду на розгалуження та швидкість змін, уточнювали ймовірні дати для кожного зразка. Так вдалося значно точніше вписати давні інфекції в історичну шкалу подій.
Новий підхід застосували не лише до 11 нових геномів, а й до 64 раніше опублікованих. Це перша систематична спроба пов’язати практично всі відомі геноми чуми XIV–XVIII століть із конкретними хвилями та спалахами, описаними в письмових джерелах.
Історик та кореспондентний автор професор Філіп Слейвін (Philip Slavin) зазначає, що покращене датування дозволило зіставити ряд зразків з окремими хвилями чуми, зафіксованими хроністами в тих самих містах і регіонах.
Війни як коридори для поширення чуми
Генетичні дані також демонструють, наскільки сильно людська діяльність впливала на рух хвороби. Нові геноми дають додаткові свідчення зв’язку спалахів чуми з Тридцятирічною війною (1618–1648) та Великою Північною війною (близько 1700–1721 років).
Армії, біженці, переселені цивільні й торговці рухалися однаковими маршрутами, створюючи умови для переносу збудника між регіонами. За словами співавторки, докторки Христіани Л. Шайб (Christiana L. Scheib), на генетичному дереві видно, як у періоди воєн Y. pestis розгалужується на нові гілки і поширюється слідами військових та переміщеного населення.
Особливо детально авторам вдалося простежити спалахи, пов’язані з Великою Північною війною. Так, під час облоги Таллінна 1710 року чума забирала життя як шведських і російських солдатів, так і мирних мешканців міста.
У сукупності дані показують, що чума була не одноразовою «середньовічною катастрофою», а тривалим фактором ризику для кількох поколінь європейців.
Чому історія чуми важлива сьогодні
Сьогодні чума вже не є серйозною загрозою для здоров’я населення Європи, але Yersinia pestis не зникла повністю. Вона й досі циркулює в природних резервуарах диких гризунів у кількох регіонах світу.
Дослідники вважають, що розуміння того, як чума закріпилася після «Чорної смерті», зберігалася століттями, а згодом зникла з Європи, може допомогти краще пояснити довготривалу поведінку інфекційних хвороб загалом. Пов’язуючи давні геноми з документованими спалахами та можливими тваринними резервуарами, можна побачити, як інфекції виникають, поширюються, закріплюються й зберігаються впродовж тривалого часу.
Подібна інформація здатна покращити сучасний епіднагляд і моніторинг у регіонах, де чума все ще циркулює. Вона також дає ширший контекст для розуміння нинішніх та майбутніх пандемій.
Найповніша на сьогодні картина Другої пандемії
Проєкт об’єднав науковців і дані з кількох країн та дисциплін. До роботи долучилися археологи, генетики, історики та фахівці з радіовуглецевого датування з різних установ Європи, зокрема й Кембриджського університету, а також партнерів з Нідерландів і Швейцарії.
Поєднавши аналіз давньої ДНК, археологічні матеріали, хроніки та радіовуглецеві дати, автори створили, за їхніми словами, найповнішу на сьогодні генетичну картину Другої пандемії чуми в Західній Євразії. Вона показує хворобу, яка століттями перетинала кордони, утворювала нові лінії, слідувала за рухом людей і продовжувала формувати історію Європи довго після завершення «Чорної смерті».
Давня ДНК показала, як чума поверталась у Європу 400 років з’явилася спочатку на Цікавості.

3676